Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18Q62280 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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