Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3cQ62181 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3cQ62181 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3cQ62181 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3cQ62181 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3cQ62181 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3cQ62181 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3cQ62181 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3cQ62181 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3cQ62181 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema3cQ62181 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms