Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC20,89■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Prm3Q62100 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20,79■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Prm3Q62100 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Prm3Q62100 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Prm3Q62100 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Prm3Q62100 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Prm3Q62100 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Prm3Q62100 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Prm3Q62100 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Prm3Q62100 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Prm3Q62100 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms