Protein–RNA interactions for Protein: Q61493

Rev3l, DNA polymerase zeta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rev3lQ61493 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rev3lQ61493 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rev3lQ61493 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rev3lQ61493 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rev3lQ61493 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rev3lQ61493 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rev3lQ61493 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rev3lQ61493 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rev3lQ61493 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms