Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vsx2Q61412 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vsx2Q61412 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsx2Q61412 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms