Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Foxd1Q61345 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Foxd1Q61345 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms