Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gata6Q61169 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gata6Q61169 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms