Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf235Q61116 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms