Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncor1Q60974 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncor1Q60974 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncor1Q60974 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncor1Q60974 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms