Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna1Q60960 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna1Q60960 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna1Q60960 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms