Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Neurod1Q60867 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Neurod1Q60867 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Neurod1Q60867 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Neurod1Q60867 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms