Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnot7Q60809 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cnot7Q60809 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot7Q60809 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot7Q60809 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms