Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MarcoQ60754 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MarcoQ60754 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MarcoQ60754 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MarcoQ60754 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MarcoQ60754 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MarcoQ60754 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MarcoQ60754 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MarcoQ60754 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MarcoQ60754 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MarcoQ60754 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MarcoQ60754 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MarcoQ60754 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MarcoQ60754 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MarcoQ60754 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MarcoQ60754 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MarcoQ60754 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MarcoQ60754 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MarcoQ60754 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MarcoQ60754 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MarcoQ60754 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MarcoQ60754 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MarcoQ60754 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MarcoQ60754 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MarcoQ60754 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MarcoQ60754 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MarcoQ60754 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MarcoQ60754 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MarcoQ60754 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MarcoQ60754 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MarcoQ60754 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MarcoQ60754 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MarcoQ60754 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MarcoQ60754 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MarcoQ60754 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MarcoQ60754 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MarcoQ60754 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MarcoQ60754 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MarcoQ60754 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MarcoQ60754 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MarcoQ60754 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MarcoQ60754 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MarcoQ60754 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MarcoQ60754 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MarcoQ60754 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MarcoQ60754 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MarcoQ60754 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MarcoQ60754 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MarcoQ60754 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms