Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P4ha1Q60715 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha1Q60715 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P4ha1Q60715 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms