Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms