Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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PtprnQ60673 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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PtprnQ60673 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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PtprnQ60673 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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PtprnQ60673 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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PtprnQ60673 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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PtprnQ60673 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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PtprnQ60673 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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PtprnQ60673 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprnQ60673 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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PtprnQ60673 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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PtprnQ60673 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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PtprnQ60673 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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PtprnQ60673 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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PtprnQ60673 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprnQ60673 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprnQ60673 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms