Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CttnQ60598 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CttnQ60598 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CttnQ60598 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CttnQ60598 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CttnQ60598 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CttnQ60598 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CttnQ60598 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CttnQ60598 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CttnQ60598 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CttnQ60598 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CttnQ60598 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CttnQ60598 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CttnQ60598 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CttnQ60598 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CttnQ60598 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CttnQ60598 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CttnQ60598 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CttnQ60598 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CttnQ60598 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms