Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp20Q5XG71 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp20Q5XG71 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp20Q5XG71 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms