Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf15Q5UBV8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf15Q5UBV8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf15Q5UBV8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf15Q5UBV8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf15Q5UBV8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf15Q5UBV8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms