Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpa6Q5U901 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms