Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thoc6Q5U4D9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Thoc6Q5U4D9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thoc6Q5U4D9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms