Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctc1Q5SUQ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctc1Q5SUQ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctc1Q5SUQ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms