Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf215Q5SPX3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.6 ms