Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5730522E02RikQ5SP45 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5730522E02RikQ5SP45 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5730522E02RikQ5SP45 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms