Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trav8d-2Q5R1B6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trav8d-2Q5R1B6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trav8d-2Q5R1B6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trav8d-2Q5R1B6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms