Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttf2Q5NC05 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttf2Q5NC05 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf2Q5NC05 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms