Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CoblQ5NBX1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CoblQ5NBX1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CoblQ5NBX1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms