Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH66

Xkr5, XK-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr5Q5GH66 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xkr5Q5GH66 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Xkr5Q5GH66 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xkr5Q5GH66 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xkr5Q5GH66 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms