Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SynaQ5G5D5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynaQ5G5D5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynaQ5G5D5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms