Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CenpjQ569L8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CenpjQ569L8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CenpjQ569L8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CenpjQ569L8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms