Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1cQ4KL78 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1cQ4KL78 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms