Protein–RNA interactions for Protein: Q4JIM5

Abl2, Abelson tyrosine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl2Q4JIM5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abl2Q4JIM5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abl2Q4JIM5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl2Q4JIM5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms