Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx25Q3ZT31 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx25Q3ZT31 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx25Q3ZT31 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx25Q3ZT31 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx25Q3ZT31 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms