Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cfap65Q3V0B4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cfap65Q3V0B4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cfap65Q3V0B4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cfap65Q3V0B4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cfap65Q3V0B4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cfap65Q3V0B4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cfap65Q3V0B4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cfap65Q3V0B4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms