Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm12888Q3UW77 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm12888Q3UW77 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm12888Q3UW77 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305.7 ms