Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defb48Q3UW22 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defb48Q3UW22 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defb48Q3UW22 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms