Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fchsd2Q3USJ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fchsd2Q3USJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fchsd2Q3USJ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms