Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp560Q3URI6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zfp560Q3URI6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp560Q3URI6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms