Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fcho2Q3UQN2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcho2Q3UQN2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho2Q3UQN2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms