Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2aQ3UP38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.7 ms