Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Washc4Q3UMB9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Washc4Q3UMB9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Washc4Q3UMB9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Washc4Q3UMB9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Washc4Q3UMB9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Washc4Q3UMB9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Washc4Q3UMB9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Washc4Q3UMB9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Washc4Q3UMB9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms