Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc61Q3UJV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc61Q3UJV1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms