Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snx27Q3UHD6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx27Q3UHD6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.4 ms