Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek10Q3UGM2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek10Q3UGM2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek10Q3UGM2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms