Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yipf3Q3UDR8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yipf3Q3UDR8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Yipf3Q3UDR8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms