Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtpbp6Q3U6U5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtpbp6Q3U6U5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp6Q3U6U5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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