Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U595 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U595 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U595 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U595 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U595 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U595 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U595 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U595 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U595 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U595 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3U595 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U595 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U595 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U595 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U595 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U595 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U595 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U595 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U595 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U595 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U595 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U595 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U595 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U595 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U595 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U595 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U595 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U595 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U595 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U595 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U595 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U595 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U595 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U595 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U595 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U595 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U595 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U595 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U595 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U595 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U595 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U595 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U595 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U595 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U595 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U595 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U595 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U595 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q3U595 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U595 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q3U595 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U595 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U595 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U595 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U595 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U595 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U595 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U595 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U595 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U595 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U595 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U595 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U595 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U595 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U595 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U595 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U595 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U595 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U595 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U595 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U595 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U595 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U595 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U595 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U595 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U595 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U595 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U595 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U595 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms