Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gse1Q3U3C9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gse1Q3U3C9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gse1Q3U3C9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms