Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hvcn1Q3U2S8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hvcn1Q3U2S8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hvcn1Q3U2S8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hvcn1Q3U2S8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms