Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Palb2Q3U0P1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Palb2Q3U0P1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.9 ms