Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc17a7Q3TXX4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc17a7Q3TXX4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms